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Expertise sur la qualité microbiologique de 6 zones de récoltes d'algues (projet ALGMARBIO) : évaluation de la stabilité et propositions d'adaptation sur les protocoles de surveillance ArchiMer
Boulben, Sylviane; Monfort, Patrick; Piquet, Jean-come; Chiffoleau, Jean-francois.
Tipo: Text
Ano: 2016 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00344/45522/79632.pdf
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Demande d'expertise sur la qualité mocrobiologique de 6 zones de récoltes d'algues (projet ALGMARBIO) : évaluation de la stabilité et propositions d'adaptation sur les protocoles de surveillance ArchiMer
Boulben, Sylviane; Monfort, Patrick; Piquet, Jean-come; Chiffoleau, Jean-francois; Le Bec, Claude.
Expertise de l’IFREMER sur la qualité microbiologique de 6 zones de récolte d’algues dans le cadre du projet ALGMARBIO, localisées en Finistère nord en baie d’Audierne, à Ploudalmezeau, au large des Abers, à Guissény, à Plouescat et à Roscoff.
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00252/36340/79157.pdf
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Quantification of Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus and Vibrio cholerae in French Mediterranean coastal lagoons ArchiMer
Cantet, Franck; Hervio-heath, Dominique; Caro, A; Le Mennec, Cecile; Monteil, Caroline; Quemere, Catherine; Jolivet-gougeon, Anne; Colwell, Rita R.; Monfort, Patrick.
Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus and Vibrio cholerae are human pathogens. Little is known about these Vibrio spp. in the coastal lagoons of France. The purpose of this study was to investigate their incidence in water, shellfish and sediment of three French Mediterranean coastal lagoons using the most probable number-polymerase chain reaction (MPN-PCR). In summer, the total number of V. parahaemolyticus in water, sediment, mussels and clams collected from the three lagoons varied from 1 to >1.1 x 10.3 MPN/l, 0.09 to 1.1 x 10.3 MPN/ml, 9 to 210 MPN/g and 1.5 to 2.1 MPN/g, respectively. In winter, all samples except mussels contained V. parahaemolyticus, but at very low concentrations. Pathogenic (tdh- or trh2-positive) V. parahaemolyticus were...
Tipo: Text Palavras-chave: Vibrio; Lagoons; Shellfish; Water; Sediment; Human pathogen.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00148/25890/23889.pdf
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Rapid proliferation of Vibrio parahaemolyticus, Vibrio vulnificus and Vibrio cholerae during freshwater flash floods in French Mediterranean coastal lagoons ArchiMer
Esteves, Kevin; Hervio-heath, Dominique; Mosser, Thomas; Rodier, Claire; Tournoud, Marie-george; Jumas-bilak, Estelle; Colwell, Rita R.; Monfort, Patrick.
V. parahaemolyticus, V. vulnificus and V. cholerae non-O1/non-O139 are present in coastal lagoons of Southern France. In these Mediterranean regions, the rivers have long low flow periods followed by short-duration or flash floods during and after heavy intense rainstorms, particularly at the end of the summer and in autumn. These floods bring large volumes of freshwater into the lagoons, reducing their salinity. Water temperatures recorded during sampling (15°C to 24°C) were favorable for presence and multiplication of vibrios. In autumn 2011, before heavy rainfalls and flash floods, salinities ranged from 31.4‰ to 36.1‰ and concentrations of V. parahaemolyticus, V. vulnificus, and V. cholerae varied from 0 to 1.5 X 103 MPN (Most Probable Number)/L, 0.7...
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00279/39038/37584.pdf
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Highly diverse recombining populations of Vibrio cholerae and Vibrio parahaemolyticus in French Mediterranean coastal lagoons ArchiMer
Esteves, Kevin; Mosser, Thomas; Aujoulat, Fabien; Hervio-heath, Dominique; Monfort, Patrick; Jumas-bilak, Estelle.
Vibrio parahaemolyticus and Vibrio cholerae are ubiquitous to estuarine and marine environments. Thes two species found in Mediterranean coastal systems can induce infection in humans. Environmental isolates of V. cholerae (n = 109) and V. parahaemotycius (n = 89) sampled at different dates, stations and water salinities were investigated for virulence genes and by a mutilocus sequence-based analysis (MLSA). V. cholerae isolate were all ctxA negative and only one isolate of V. parahaemolyticus displayed trh2 gene. Most Sequence Types (ST) corresponded to uique ST isolated at one date or one station. Frequent recombination events were detected among different pathogenic species, V. parahaemotyticus, V. cholerae, Vibrio mimicus, and Vibrio metoecus....
Tipo: Text Palavras-chave: Vibrio; Human pathogens; French coastal lagoons; Phylogeny; Recombination; Multi-locus sequence analysis; Virulence factor.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00274/38528/37039.pdf
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Impact de la pisciculture marine intensive sur l'environnement : (2) l'environnement d'un site d'élevage de salmonidés en cages flottantes, Camaret année 1994 ArchiMer
Kempf, Marc; Jacq, E; Le Guellec, C; Merceron, Michel; Monfort, Patrick; Nezan, Elisabeth; Ryckaert, Mireille.
This document presents a year-long (1994) environmental study conducted on a site of intensive farming of salmonids (mainly fario trout) in Camaret Bay. A set of parameters were considered for the body of water and the sea bed (flow patterns, hydrology, sedimentology, biology, chemistry) and complemented by video observations. The study concluded that there was a measurable effect from the farm in its current configuration, but that the impact was of a very limited intensity and scope that did not affect the environment in a substantial way. It is recommended that production growth be accompanied by a minimum amount of environmental assessment.
Tipo: Text Palavras-chave: Bretagne; Truite fario; Salmonidés; Environnement; Pisciculture marine.
Ano: 1995 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/1995/rapport-2834.pdf
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Influence of temperature, salinity and E. coli tissue content on immune gene expression in mussel: Results from a 2005-2008 survey ArchiMer
Li, Hui; Toubiana, Mylene; Monfort, Patrick; Roch, Philippe.
Several bivalves, including mussels, suffered from mortalities particularly in summer. To look for the possible effect of environmental parameters on immune capacities, Mytilus galloprovincialis were collected monthly from August 2005 to July 2008 from the Palavas Laguna, French Mediterranean coast. Q-PCR was used to quantify the expression of three antimicrobial peptide genes (defensin, mytilin B and myticin B), in addition to lysozyme and HSP70. House keeping gene was 28S rRNA. Defensin, myticin B and lysozyme appeared more expressed in spring-summer than in winter. In contrast, HSP70 expression was higher in winter. Statistical studies using principal component analysis (PCA) and multiple regression models revealed positive influence of temperature on...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusks; Mytilus; Innate immunity; Seasonal variations; Immune survey; Q PCR; HSP70; Lysozyme; Myticin; Mytilin; Defensin; Antimicrobial peptide.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2009/publication-7345.pdf
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Etude sanitaire microbiologique - Site de Kermeur sur la ria du Bélon ArchiMer
Monfort, Patrick.
Tipo: Text
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00023/13421/10433.pdf
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Etude sanitaire microbiologique. Zone aval de la ria de l'Odet ArchiMer
Monfort, Patrick.
L'activité conchylicole emblématique de l'estuaire de l'Odet était tournée pendant des décennies vers l'ostréiculture et tout particulièrement l'exploitation du gisement d'huîtres plates du Perennou. Les mortalités importantes enregistrées dans les années 70 et 80 liées à la présence des parasites Martelia et Bonamia, associées à la médiocrité de la qualité sanitaire des eaux estuariennes ont participé au déclin de cette activité primaire sur ce territoire. Une volonté locale forte au sein de la Commission Locale de l'Eau (CLE) du Schéma d'Aménagement et de Gestion des Eaux (SAGE) de réhabiliter la qualité bactériologique en priorité puis corrélativement l'activité conchylicole ont contribué au regain d'intérêt de cet estuaire manifesté par les...
Tipo: Text Palavras-chave: Contamination fécale; Escherichia coli; Plomb; Cadmium; Mercure; Zone conchylicole; Ceratoculture; Odet.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00175/28616/27044.pdf
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Qualité sanitaire des gisements naturels de coquillages. Finistère. Pêche à pied récréative. Année 2017 ArchiMer
Monfort, Patrick; Boulben, Sylviane; Kerebel, Thomas.
Le présent document dresse le bilan de la qualité sanitaire de l'ensemble des gisements naturels suivis par l'ARS Bretagne et l'Ifremer dans le département du Finistère, sur la période 2014-2016. Ce rapport s'inscrit dans le cadre du projet RESP²ONsable, mené par l'Ifremer et l'ARS Bretagne depuis 2013 sur la communication des risques sanitaires de la pêche à pied récréative. Son support principal est un site internet mettant à disposition du public une information complète et actualisée, à l'échelle de la Bretagne.  
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00393/50394/51106.pdf
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Le bassin versant du Bélon : vers une restauration durable de la qualité bactériologique des eaux estuariennes ArchiMer
Monfort, Patrick; Hervio Heath, Dominique; Caprais, Marie-paule; Pommepuy, Monique; Annezo, Jean-pierre; Loaec, Solen; Le Mennec, Cecile; Guillerm, Emmanuelle; Boulben, Sylviane; Bilien, Gwenael; Bonsor, Robert; Porter, Jonathan; Pickup, Roger.
Le projet européen Cycleau, initié à l'échelle locale sur la problèmatique de l'envasement et de l'ensablement de l'estuaire du Bélon, y a également intégré un volet bactériologique en raison des contraintes fortes que faisaient peser les pics conjoncturels de contamination sur la profession conchylicole (fermetures temporaires, déclassement éventuel) mais plus largement sur l'image du territoire (impact touristique) et en définitive sur son développement durable. Pour satisfaire la restauration de la qualité des eaux estuariennes, l'IFREMER a fait appel à un certain nombre d'outils susceptibles de contribuer à la formulation d'un diagnostic pertinent et ainsi de répondre aux préoccupations des acteurs du littoral. Pour ce faire, nous avons créé un réseau...
Tipo: Text Palavras-chave: Bassin versant; Contamination fécale; Escherichia coli; Flux bactériens; Bactériophages; SIG; Évaluation.
Ano: 2006 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00200/31077/29490.pdf
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Qualité sanitaire des gisements naturels de coquillages. Finistère. Pêche à pied récréative. Année 2016 ArchiMer
Monfort, Patrick; Kérebel, Thomas.
Le présent document dresse le bilan de la qualité sanitaire de l’ensemble des gisements naturels suivis par l’ARS Bretagne et l’Ifremer dans le département du Morbihan, sur la période 2013-2015. Ce rapport s’inscrit dans le cadre du projet RESP²ONsable, mené par l’Ifremer et l’ARS Bretagne depuis 2013 sur la communication des risques sanitaires de la pêche à pied récréative. Son support principal est un site internet mettant à disposition du public une information complète et actualisée, à l’échelle de la Bretagne.
Tipo: Text
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00340/45127/44543.pdf
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Etude sanitaire du bassin versant du Goyen ArchiMer
Monfort, Patrick; Le Bec, Claude; Boulben, Sylviane.
Tipo: Text
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00017/12866/9812.pdf
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Etude sanitaire microbiologique. Ria de la rivière de Morlaix ArchiMer
Monfort, Patrick; Lebrun, Luc.
La rivière de Morlaix est traditionnellement et exclusivement tournée vers la production d’huîtres creuses depuis des décennies. Dans ce contexte d’activité conchylicole, elle fait l’objet d’un classement sanitaire pour les coquillages du groupe 3 pris par arrêté préfectoral n° 2012 2361-0003 en date du 26/12/2012. Le Comité Régional de la Conchyliculture (CRC) et le Comité Régional des Pêches Maritimes et des Elevages Marins (CRPMEM) ont conjointement sollicité la Direction Départementale des Territoires et de la Mer (DDTM) pour entreprendre une étude sanitaire sur les coquillages du groupe 2 (coques et palourdes). Cette demande s’inscrit dans un double objectif de diversification de la production conchylicole dans un contexte difficile de mortalités...
Tipo: Text Palavras-chave: Rivière de Morlaix; Contamination fécale; Escherichia coli; Plomb; Cadmium; Mercure; Dioxines; Polychlorobiphényles; Benzo(a)pyrène; Zone conchylicole; Palourde.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00276/38735/37252.pdf
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Etude sanitaire microbiologique. Ria de la rivière du Faou ArchiMer
Monfort, Patrick; Lebrun, Luc.
L'activité conchylicole sur la rivière du Faou se résume pour l'heure à l'élevage d'huîtres creuses pour lequel d'estuaire est classé en zone de salubrité B. Suite à la sollicitation du Comité Régional des Pêches Maritimes et des Elevages Marins (CRPMEM) de Bretagne pour y entreprendre une étude sanitaire sur les coquillages du groupe 2 (palourdes), l'administration départementale a donné un avis favorable et mission l'Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la MER (Ifremer) pour mener à bien cette étude. Les résultats obtenus ont mis en évidence une qualité chimique satisfaisante des palourdes et à l'opposé, une qualité bactériologique médiocre, induisant une estimation de la qualité en zone de salubrité C pour ces bivalves du groupe 2. En...
Tipo: Text Palavras-chave: Rivière du Faou; Contamination fécale; Escherichia coli; Plomb; Cadmium; Mercure; Dioxines; Polychlorobiphényles; Benzo(a)pyrène; Zone conchyli cole; Palourdes.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00249/36053/34603.pdf
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Etude de zone microbiologique. Ria de la rivière du Faou ArchiMer
Monfort, Patrick; Lebrun, Luc.
L'activité conchylicole sur la rivière du Faou se résume pour l'heure à l'élevage d'huîtres creuses pour lequel l'estuaire est classé en zone de salubrité B. Suite à la sollicitation du Comité Régional des Pêches Maritimes et des Elevages Marins (CRPMEM) de Bretagne pour y entreprendre une étude sanitaire sur les coquillages du groupe 2, l'administration départementale a donné un avis favorable et missionné l'Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la MER (IFREMER) pour mener à bien cette étude. Ce rapport préliminaire ne traite que les données bactériologiques et chimiques des coquillages acquises dans le cadre du suivi sanitaire et ceci dans un souci d'une transmission rapide de l'information aux acteurs concernés. Le second volet relatif...
Tipo: Text Palavras-chave: Rivière du Faou; Contamination fécale; Escherichia coli; Plomb; Cadmium; Mercure; Dioxines; Polychlorobiphényles; Benzo(a)pyrène; Zone conchylicole; Palourdes..
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00195/30650/29121.pdf
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Etude sanitaire microbiologique - Site de la Baie de Goulven ArchiMer
Monfort, Patrick; Lebrun, Luc.
Sur le plan conchylicole, la baie de Goulven est exclusivement concernée par les gisements de coques, aucune activité de production de coquillages n’y étant pratiquée. Le Comité Régional des Pêches Maritimes et des Elevages Marins (CRPMEM), après avoir engagé une évaluation du stock de bivalves par un bureau d’études (Allain et Bernard 2015), a sollicité la Direction Départementale des Territoires et de la Mer (DDTM) du Finistère pour entreprendre une étude sanitaire et permettre ainsi le classement sanitaire de cette zone et son accès pour les pêcheurs à pied professionnels. Ayant répondu favorablement à cette demande de la profession, l’administration a missionné le laboratoire Ifremer de Concarneau pour mener à bien cette étude. Les résultats obtenus...
Tipo: Text Palavras-chave: Baie de Goulven; Contamination fécale; Escherichia coli; Plomb; Cadmium; Mercure; Dioxines; Polychlorobiphényles; Benzo(a)pyrène; Zone conchylicole; Coques..
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00369/48023/48109.pdf
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Etude sanitaire microbiologique - Site de la rivière de Penzé ArchiMer
Monfort, Patrick; Lebrun, Luc.
L’ostréiculture en baie de Morlaix demeure une activité emblématique du territoire qui contribue à sa notoriété ainsi qu’à son attractivité. Cette activité du secteur primaire, qui emploie 107 personnes en Equivalent Temps Plein (ETP), produit annuellement environ 7000 tonnes d’huîtres creuses et environ 90 tonnes d’huîtres plates ce qui représentent indéniablement un poids socio-économique significatif à l’échelon local. Le Comité Régional des Pêches Maritimes et des Elevages Marins (CRPMEM), après avoir engagé une évaluation du stock de bivalves fouisseurs (coques et palourdes) par un bureau d’études (Allain et Bernard 2015), a sollicité la Direction Départementale des Territoires et de la Mer (DDTM) du Finistère pour entreprendre une étude sanitaire de...
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00372/48287/48387.pdf
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Etude de zone microbiologique. Ria de la rivière de Morlaix ArchiMer
Monfort, Patrick; Lebrun, Luc.
La rivière de Morlaix est traditionnellement et exclusivement tournée vers la production d'huîtres creuses depuis des décennies. Dans ce contexte d'activité conchylicole, elle fait l'objet d'un classement sanitaire pour les coquillages du groupe 3 pris par l'arrêté préfectoral n° 2012 2361-0003 en date du 26/12/2012. Le Comité Régional de la Conchyliculture (CRC) et le Comité Régional des Pêches Maritimes et des Elevages Marins (CRPMEM) ont conjointement sollicité la Direction Départementale des Territoires et de la Mer (DDTM) pour entreprendre une étude sanitaire sur les coquillages du groupe 2 (coques et palourdes). Cette demande s'inscrit dans un double objectif de diversification de la production conchylicole dans un contexte difficile de mortalités...
Tipo: Text Palavras-chave: Rivière de Morlaix; Contamination fécale; Escherichia coli; Plomb; Cadmium; Mercure; Dioxines; Polychlorobiphényles; Benzo(a)pyrène; Zone conchylicole; Palourdes..
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00238/34949/33337.pdf
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Zones conchylicoles de l'Aven, du Bélon et du Merrien : Bilan de 15 ans de surveillance ArchiMer
Monfort, Patrick; Nicol, P.
L’activité conchylicole sur les estuaires du Sud Est Cornouaille en Finistère est un enjeu majeur en raison de son importance socio-économique à l’échelle locale. Cette filière est soumise a de multiples contraintes et notamment au respect de la qualité sanitaire des produits finis,  à l’origine de potentielles Toxi-Infections Alimentaires (TIA) qui peuvent fragiliser sa pérennité. La qualité microbiologique des eaux littorales est donc un point essentiel à maîtriser pour limiter les risques sanitaires liés à la consommation de ces fruits de la mer. Pour ce faire, différents moyens ont été mis en place, qu’il s’agisse de la réglementation des zones conchylicoles à l’échelon national ou de l’élaboration d’actions de restauration de la qualité des eaux à...
Tipo: Text Palavras-chave: Rivière de l’Aven; Rivière du Bélon; Rivière de Merrien; Contamination fécale; Escherichia coli; Plomb; Cadmium; Mercure; PCB; Dioxines; HAP; Ostréiculture.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00388/49955/50528.pdf
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